Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSPP1Q1MSJ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CSPP1Q1MSJ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSPP1Q1MSJ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms