Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LONRF1Q17RB8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LONRF1Q17RB8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LONRF1Q17RB8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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