Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPN21Q16825 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN21Q16825 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTPN21Q16825 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN21Q16825 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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