Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STX1AQ16623 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX1AQ16623 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STX1AQ16623 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX1AQ16623 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms