Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCN1Q15293 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCN1Q15293 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCN1Q15293 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCN1Q15293 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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