Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB3GAP1Q15042 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RAB3GAP1Q15042 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB3GAP1Q15042 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
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RAB3GAP1Q15042 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAB3GAP1Q15042 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB3GAP1Q15042 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
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