Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.148e-8■■■■□ 20.3
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PUM1Q14671 TYMS-205ENST00000581920 886 ntTSL 59.09□□□□□ -0.951e-6■■■■□ 20.3
PUM1Q14671 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.928e-8■■■■□ 20.3
PUM1Q14671 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.398e-8■■■■□ 20.3
PUM1Q14671 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.526e-9■■■■□ 20.3
PUM1Q14671 DNMT1-209ENST00000586799 672 ntTSL 513.51□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 20.3
PUM1Q14671 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.385e-15■■■■□ 20.3
PUM1Q14671 HIST1H3D-203ENST00000635641 1637 ntTSL 516.92■□□□□ 0.35e-15■■■■□ 20.3
PUM1Q14671 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.295e-15■■■■□ 20.3
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PUM1Q14671 HDAC1-204ENST00000471488 726 ntTSL 57.9□□□□□ -1.143e-8■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.68□□□□□ -1.828e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 CEP131-206ENST00000571292 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.32■□□□□ 0.845e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 CEP131-205ENST00000570817 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.85e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 CEP131-207ENST00000573053 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.85■□□□□ 0.775e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.025e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.145e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.155e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.235e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.365e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.475e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 PDCD6IP-209ENST00000473593 540 ntTSL 25.05□□□□□ -1.65e-9■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.761e-7■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.481e-7■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 PFDN6-207ENST00000491382 989 ntTSL 216.4■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 20.2
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PUM1Q14671 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 20.2
PUM1Q14671 PFDN6-205ENST00000395134 805 ntTSL 29.04□□□□□ -0.961e-7■■■■□ 20.2
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PUM1Q14671 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.294e-7■■■■□ 20.1
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PUM1Q14671 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 20.1
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PUM1Q14671 CMSS1-203ENST00000478909 753 ntTSL 55.7□□□□□ -1.52e-11■■■■□ 20.1
PUM1Q14671 CMSS1-209ENST00000497345 538 ntTSL 34.65□□□□□ -1.672e-11■■■■□ 20.1
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PUM1Q14671 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.772e-7■■■■□ 19.9
PUM1Q14671 SLC6A8-203ENST00000429147 334 ntTSL 217.11■□□□□ 0.339e-13■■■■□ 19.9
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PUM1Q14671 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.315e-8■■■■□ 19.9
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PUM1Q14671 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 19.9
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PUM1Q14671 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.795e-7■■■■□ 19.9
PUM1Q14671 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 19.8
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PUM1Q14671 ELMSAN1-208ENST00000476562 5314 ntTSL 219.36■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.182e-7■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 PNPLA2-204ENST00000529255 1301 ntTSL 1 (best)17.4■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 PNPLA2-203ENST00000526083 465 ntTSL 217.18■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 PNPLA2-202ENST00000525250 2726 ntTSL 216.94■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 GTF2I-211ENST00000491325 539 ntTSL 47.48□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 19.8
PUM1Q14671 ADD1-215ENST00000510101 704 ntTSL 326.93■■□□□ 1.92e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.932e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-213ENST00000508684 3059 ntTSL 220.12■□□□□ 0.812e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.12e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.092e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-212ENST00000508277 491 ntTSL 511.65□□□□□ -0.542e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-216ENST00000511797 671 ntTSL 510.73□□□□□ -0.692e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.72e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.722e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.852e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-214ENST00000509039 1569 ntTSL 29.35□□□□□ -0.912e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-209ENST00000503169 2394 ntTSL 27.79□□□□□ -1.162e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 ADD1-220ENST00000534870 795 ntTSL 25.5□□□□□ -1.532e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 TARS-211ENST00000509410 782 ntTSL 34.81□□□□□ -1.642e-12■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.122e-7■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-227ENST00000634760 5847 ntTSL 520.45■□□□□ 0.867e-8■■■■□ 19.7
PUM1Q14671 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.057e-8■■■■□ 19.7
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