Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX39BQ13838 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX39BQ13838 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX39BQ13838 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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