Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGA9Q13797 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA9Q13797 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA9Q13797 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA9Q13797 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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