Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CUL4BQ13620 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CUL4BQ13620 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CUL4BQ13620 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL4BQ13620 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
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