Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK5R2Q13319 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK5R2Q13319 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK5R2Q13319 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms