Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.931e-10■■■■■ 44.5
PABPC4Q13310 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.761e-10■■■■■ 44.5
PABPC4Q13310 C21orf59-204ENST00000425336 873 ntTSL 216.59■□□□□ 0.251e-10■■■■■ 44.5
PABPC4Q13310 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 01e-10■■■■■ 44.5
PABPC4Q13310 AP000275.2-201ENST00000431216 891 ntAPPRIS P1 TSL 511.68□□□□□ -0.541e-10■■■■■ 44.5
PABPC4Q13310 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.55■□□□□ 0.725e-6■■■■■ 44.4
PABPC4Q13310 UBE2M-203ENST00000595957 734 ntTSL 217.4■□□□□ 0.381e-27■■■■■ 44.4
PABPC4Q13310 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.189e-9■■■■■ 44.3
PABPC4Q13310 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.529e-9■■■■■ 44.3
PABPC4Q13310 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.529e-9■■■■■ 44.3
PABPC4Q13310 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.079e-9■■■■■ 44.3
PABPC4Q13310 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.64e-8■■■■■ 44.3
PABPC4Q13310 AC087289.3-201ENST00000590947 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.9■□□□□ 0.624e-8■■■■■ 44.3
PABPC4Q13310 MRPL38-212ENST00000486101 767 ntTSL 214.38□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 44.3
PABPC4Q13310 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.039e-13■■■■■ 44.3
PABPC4Q13310 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.713e-16■■■■■ 44.3
PABPC4Q13310 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.253e-16■■■■■ 44.3
PABPC4Q13310 ATP5D-204ENST00000589478 640 ntTSL 223.56■■□□□ 1.368e-18■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 ATP5D-209ENST00000614837 343 ntTSL 218.31■□□□□ 0.528e-18■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 DMPK-212ENST00000597660 803 ntTSL 322.95■■□□□ 1.268e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.827e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.128e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.786e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.216e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.26e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.756e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 ZFAND2B-214ENST00000464902 1851 ntTSL 225.58■■□□□ 1.696e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 ZFAND2B-210ENST00000425849 484 ntTSL 316.41■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.425e-24■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.285e-24■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.25e-24■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.145e-24■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.145e-24■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.075e-24■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.045e-24■■■■■ 44.2
PABPC4Q13310 PSMD7-206ENST00000568717 1395 ntTSL 223.32■■□□□ 1.325e-26■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.892e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.832e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 BTG3-204ENST00000464058 531 ntTSL 220.15■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 BTG3-203ENST00000457956 511 ntTSL 319.24■□□□□ 0.672e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 CYTH1-206ENST00000586299 4423 nt15.44■□□□□ 0.062e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.192e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.382e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.032e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.842e-8■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.112e-8■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 RPUSD3-203ENST00000423108 756 ntTSL 214.6□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 RPUSD3-211ENST00000464783 1149 ntTSL 214.29□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 RPUSD3-212ENST00000466141 996 ntTSL 28.54□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.324e-9■■■■■ 44.1
PABPC4Q13310 MGAT4B-216ENST00000520969 1096 ntTSL 326.28■■□□□ 1.81e-10■■■■■ 44
PABPC4Q13310 MGAT4B-205ENST00000518778 1568 ntTSL 1 (best)24.5■■□□□ 1.511e-10■■■■■ 44
PABPC4Q13310 MGAT4B-209ENST00000519836 1686 ntTSL 1 (best)23.25■■□□□ 1.311e-10■■■■■ 44
PABPC4Q13310 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.251e-10■■■■■ 44
PABPC4Q13310 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.411e-10■■■■■ 44
PABPC4Q13310 NAGA-201ENST00000396398 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-22■■■■■ 43.9
PABPC4Q13310 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.332e-8■■■■■ 43.9
PABPC4Q13310 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 43.9
PABPC4Q13310 PRPSAP2-212ENST00000466106 1419 ntTSL 218.17■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 43.9
PABPC4Q13310 PRPSAP2-228ENST00000610773 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 43.9
PABPC4Q13310 PRPSAP2-215ENST00000492129 1835 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 43.9
PABPC4Q13310 APOE-202ENST00000425718 923 ntTSL 1 (best)28.28■■■□□ 2.121e-6■■■■■ 43.8
PABPC4Q13310 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 226.06■■□□□ 1.761e-6■■■■■ 43.8
PABPC4Q13310 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.542e-8■■■■■ 43.7
PABPC4Q13310 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 43.7
PABPC4Q13310 ZMAT2-202ENST00000506644 735 ntTSL 39.83□□□□□ -0.842e-18■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.194e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.554e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.744e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.524e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 TARS2-210ENST00000467982 1855 ntTSL 518.2■□□□□ 0.54e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.254e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 TARS2-201ENST00000369051 2106 ntTSL 515.8■□□□□ 0.124e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.114e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.014e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.044e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 TARS2-204ENST00000369064 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.344e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 FMNL3-203ENST00000549137 2650 ntTSL 512.69□□□□□ -0.384e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 ITPR1-219ENST00000544951 4131 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.434e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 FMNL3-201ENST00000335154 12634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.644e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 SNX24-207ENST00000510914 532 ntTSL 38.62□□□□□ -1.034e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.084e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.084e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.134e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.154e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.164e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 WDR48-202ENST00000413099 2300 ntTSL 27.5□□□□□ -1.214e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 SNX24-203ENST00000502387 500 ntTSL 56.44□□□□□ -1.384e-10■■■■■ 43.6
PABPC4Q13310 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.041e-7■■■■■ 43.4
PABPC4Q13310 AP2S1-208ENST00000600964 458 ntTSL 1 (best)22.32■■□□□ 1.161e-16■■■■■ 43.4
PABPC4Q13310 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 43.4
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