Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUSP4Q13115 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP4Q13115 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP4Q13115 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DUSP4Q13115 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
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