Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSTF3Q12996 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSTF3Q12996 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSTF3Q12996 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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