Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOXD4Q12950 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXD4Q12950 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXD4Q12950 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXD4Q12950 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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