Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 GNAI2-206ENST00000446079 2086 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.021e-6■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-6■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 GNAI2-211ENST00000491100 3886 ntTSL 28.63□□□□□ -1.031e-6■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 LONP1-204ENST00000586617 471 ntTSL 526.98■■□□□ 1.913e-8■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 LONP1-210ENST00000590511 722 ntTSL 326.09■■□□□ 1.773e-8■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 LONP1-205ENST00000587365 641 ntTSL 525.32■■□□□ 1.643e-8■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 LONP1-212ENST00000590728 591 ntTSL 425.23■■□□□ 1.633e-8■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.953e-8■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.573e-8■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.493e-8■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.073e-8■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 RFLNA-203ENST00000389727 2385 ntAPPRIS P2 TSL 519.17■□□□□ 0.661e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.161e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 RFLNA-204ENST00000545615 449 ntTSL 312.4□□□□□ -0.421e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 ZNF664-201ENST00000337815 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.721e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 SNF8-208ENST00000510195 445 ntTSL 228.43■■■□□ 2.141e-7■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 SNF8-213ENST00000514929 775 ntTSL 525.92■■□□□ 1.741e-7■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 SNF8-217ENST00000576353 700 ntTSL 524.67■■□□□ 1.541e-7■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 SNF8-209ENST00000510558 1051 ntTSL 524.36■■□□□ 1.491e-7■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 SNF8-216ENST00000573795 583 ntTSL 523.59■■□□□ 1.371e-7■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.211e-7■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 SNF8-205ENST00000507302 742 ntTSL 317.84■□□□□ 0.451e-7■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 SNF8-201ENST00000290330 951 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.631e-7■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 410.29□□□□□ -0.761e-6■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-9■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.297e-8■■■□□ 16.4
GRSF1Q12849 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.563e-6■■■□□ 16.3
GRSF1Q12849 FAM20B-202ENST00000440702 603 ntTSL 318.41■□□□□ 0.543e-6■■■□□ 16.3
GRSF1Q12849 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.875e-12■■■□□ 16.3
GRSF1Q12849 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.625e-12■■■□□ 16.3
GRSF1Q12849 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-8■■■□□ 16.3
GRSF1Q12849 HNRNPM-207ENST00000597081 1004 ntTSL 522.07■■□□□ 1.123e-19■■■□□ 16.2
GRSF1Q12849 HNRNPM-208ENST00000597270 1147 ntTSL 221.78■■□□□ 1.083e-19■■■□□ 16.2
GRSF1Q12849 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.923e-19■■■□□ 16.2
GRSF1Q12849 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 517.95■□□□□ 0.463e-19■■■□□ 16.2
GRSF1Q12849 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.433e-19■■■□□ 16.2
GRSF1Q12849 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.343e-19■■■□□ 16.2
GRSF1Q12849 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.06□□□□□ -2.241e-323■■■□□ 16.2
GRSF1Q12849 SMARCC1-203ENST00000454240 636 ntTSL 329.05■■■□□ 2.243e-7■■■□□ 16.2
GRSF1Q12849 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.543e-7■■■□□ 16.2
GRSF1Q12849 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 27.42□□□□□ -1.223e-7■■■□□ 16.2
GRSF1Q12849 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.675e-7■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.675e-7■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-8■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-8■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-8■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 AL080251.1-201ENST00000494072 4369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.571e-8■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 RASA2-207ENST00000515549 494 ntTSL 418.99■□□□□ 0.632e-6■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 RASA2-201ENST00000286364 5614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 NFATC2IP-202ENST00000562977 638 ntTSL 428.47■■■□□ 2.151e-6■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 NFATC2IP-204ENST00000565752 823 ntTSL 223.5■■□□□ 1.351e-6■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-6■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 NFATC2IP-205ENST00000565919 576 ntTSL 414.17□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 NFATC2IP-203ENST00000564978 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.961e-6■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.687e-7■■■□□ 16.1
GRSF1Q12849 IMPDH2-209ENST00000484872 643 ntTSL 25.76□□□□□ -1.492e-11■■■□□ 16
GRSF1Q12849 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.091e-11■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.422e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.282e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.972e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-203ENST00000594165 986 ntTSL 319.94■□□□□ 0.782e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-209ENST00000597793 1716 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.752e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-207ENST00000596424 625 ntTSL 219.38■□□□□ 0.692e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.212e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-210ENST00000598325 1438 ntTSL 515.65■□□□□ 0.12e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.022e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-218ENST00000601612 1480 ntTSL 213.95□□□□□ -0.182e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PTOV1-216ENST00000601093 522 ntTSL 212.15□□□□□ -0.462e-10■■■□□ 16
GRSF1Q12849 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.752e-6■■■□□ 16
GRSF1Q12849 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■■□□ 16
GRSF1Q12849 PRNP-204ENST00000457586 855 ntTSL 1 (best)24.9■■□□□ 1.587e-7■■■□□ 15.9
GRSF1Q12849 PRNP-202ENST00000424424 806 ntTSL 1 (best)19.62■□□□□ 0.737e-7■■■□□ 15.9
GRSF1Q12849 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.087e-7■■■□□ 15.9
GRSF1Q12849 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.167e-7■■■□□ 15.9
GRSF1Q12849 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.513e-6■■■□□ 15.9
GRSF1Q12849 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-7■■■□□ 15.9
GRSF1Q12849 SLC20A1-207ENST00000490674 3202 ntTSL 1 (best)6.29□□□□□ -1.42e-7■■■□□ 15.9
GRSF1Q12849 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.741e-8■■■□□ 15.8
GRSF1Q12849 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.982e-11■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.159e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 ALDH16A1-204ENST00000593417 2343 ntTSL 221.66■■□□□ 1.069e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.999e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.269e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 ALDH16A1-207ENST00000599652 3995 ntTSL 213.51□□□□□ -0.259e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.327e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 CCDC183-205ENST00000481601 1556 ntTSL 216.94■□□□□ 0.37e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 CCDC183-202ENST00000371682 1437 ntTSL 516.93■□□□□ 0.37e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.227e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 CCDC183-204ENST00000479371 1786 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -07e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 CCDC183-203ENST00000430612 2321 ntTSL 214.43□□□□□ -0.17e-12■■■□□ 15.7
GRSF1Q12849 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.532e-7■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.889e-8■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 NOP53-207ENST00000598681 1358 ntTSL 523.14■■□□□ 1.299e-8■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 NOP53-204ENST00000595143 810 ntTSL 521.25■□□□□ 0.999e-8■■■□□ 15.6
GRSF1Q12849 NOP53-212ENST00000600410 4185 ntTSL 216.37■□□□□ 0.219e-8■■■□□ 15.6
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