Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC173Q0VFZ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC173Q0VFZ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC173Q0VFZ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms