Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXM1Q08050 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXM1Q08050 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXM1Q08050 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.4 ms