Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACTN3Q08043 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACTN3Q08043 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACTN3Q08043 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms