Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COL16A1Q07092 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
COL16A1Q07092 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
COL16A1Q07092 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
COL16A1Q07092 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
COL16A1Q07092 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
COL16A1Q07092 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
COL16A1Q07092 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.81■■■■□ 3
COL16A1Q07092 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
COL16A1Q07092 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
COL16A1Q07092 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
COL16A1Q07092 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.8■■■■□ 3
COL16A1Q07092 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
COL16A1Q07092 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COL16A1Q07092 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.79■■■■□ 3
COL16A1Q07092 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COL16A1Q07092 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
COL16A1Q07092 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COL16A1Q07092 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
COL16A1Q07092 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COL16A1Q07092 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.79■■■■□ 3
COL16A1Q07092 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.79■■■■□ 3
COL16A1Q07092 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.78■■■■□ 3
COL16A1Q07092 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
COL16A1Q07092 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
COL16A1Q07092 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
COL16A1Q07092 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
COL16A1Q07092 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
COL16A1Q07092 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
COL16A1Q07092 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
COL16A1Q07092 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
COL16A1Q07092 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
COL16A1Q07092 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL16A1Q07092 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.3 ms