Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FMODQ06828 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FMODQ06828 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FMODQ06828 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FMODQ06828 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FMODQ06828 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FMODQ06828 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FMODQ06828 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FMODQ06828 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FMODQ06828 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FMODQ06828 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FMODQ06828 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FMODQ06828 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FMODQ06828 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FMODQ06828 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FMODQ06828 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FMODQ06828 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FMODQ06828 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FMODQ06828 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FMODQ06828 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FMODQ06828 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FMODQ06828 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FMODQ06828 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FMODQ06828 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FMODQ06828 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FMODQ06828 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FMODQ06828 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FMODQ06828 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FMODQ06828 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FMODQ06828 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FMODQ06828 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FMODQ06828 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FMODQ06828 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FMODQ06828 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FMODQ06828 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FMODQ06828 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FMODQ06828 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FMODQ06828 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FMODQ06828 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FMODQ06828 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FMODQ06828 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FMODQ06828 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FMODQ06828 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FMODQ06828 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FMODQ06828 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FMODQ06828 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FMODQ06828 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FMODQ06828 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FMODQ06828 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FMODQ06828 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FMODQ06828 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FMODQ06828 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FMODQ06828 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FMODQ06828 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FMODQ06828 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FMODQ06828 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FMODQ06828 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FMODQ06828 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FMODQ06828 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FMODQ06828 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FMODQ06828 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FMODQ06828 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FMODQ06828 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FMODQ06828 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FMODQ06828 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FMODQ06828 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FMODQ06828 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FMODQ06828 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FMODQ06828 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FMODQ06828 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FMODQ06828 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FMODQ06828 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FMODQ06828 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FMODQ06828 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FMODQ06828 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FMODQ06828 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FMODQ06828 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FMODQ06828 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FMODQ06828 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FMODQ06828 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FMODQ06828 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FMODQ06828 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FMODQ06828 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FMODQ06828 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FMODQ06828 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FMODQ06828 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FMODQ06828 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FMODQ06828 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FMODQ06828 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FMODQ06828 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms