Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PAX8Q06710 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PAX8Q06710 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX8Q06710 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms