Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 KIN1YDR122W 3195 nt7.55□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 ERG12YMR208W 1332 nt7.54□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 ARE2YNR019W 1929 nt7.54□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 CRF1YDR223W 1404 nt7.54□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 PTC4YBR125C 1182 nt7.54□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 AMN1YBR158W 1650 nt7.54□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 YDR015CYDR015C 240 nt7.53□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.53□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 YJR154WYJR154W 1041 nt7.53□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 GLC8YMR311C 690 nt7.53□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 HSM3YBR272C 1443 nt7.52□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 PPT1YGR123C 1542 nt7.52□□□□□ -1.2
UBX2Q04228 HHY1YEL059W 309 nt7.52□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 SYF2YGR129W 648 nt7.52□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 BUD32YGR262C 786 nt7.52□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 SUR7YML052W 909 nt7.52□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 RSP5YER125W 2430 nt7.52□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 NHA1YLR138W 2958 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 RAD59YDL059C 717 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 DOT5YIL010W 648 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 GTO3YMR251W 1101 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.51□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 MTR3YGR158C 753 nt7.5□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 RRN10YBL025W 438 nt7.5□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 IRC11YOR013W 471 nt7.5□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 YJL045WYJL045W 1905 nt7.5□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 STT3YGL022W 2157 nt7.5□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 EDE1YBL047C 4146 nt7.49□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 YLL066CYLL066C 3618 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 YLL067CYLL067C 3618 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 ECM19YLR390W 339 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 SHP1YBL058W 1272 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 CSL4YNL232W 879 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 YPL102CYPL102C 303 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt7.48□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 SKS1YPL026C 1509 nt7.47□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 MDE1YJR024C 735 nt7.47□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 DID2YKR035W-A 615 nt7.47□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 POX1YGL205W 2247 nt7.47□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 YGR054WYGR054W 1929 nt7.46□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 RSC30YHR056C 2652 nt7.46□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 CLN1YMR199W 1641 nt7.46□□□□□ -1.21
UBX2Q04228 PUS7YOR243C 2031 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 GCV3YAL044C 513 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 SMK1YPR054W 1167 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 LDB16YCL005W 771 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 YBR241CYBR241C 1467 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 MTF2YDL044C 1323 nt7.46□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 YNL200CYNL200C 741 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 YNL285WYNL285W 372 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 ECM31YBR176W 939 nt7.45□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 snR82snR82 268 nt7.44□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 MIA40YKL195W 1212 nt7.44□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 MAK31YCR020C-A 267 nt7.43□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 YLR126CYLR126C 756 nt7.43□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 CAF40YNL288W 1122 nt7.43□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt7.43□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 MCH2YKL221W 1422 nt7.43□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 RIX7YLL034C 2514 nt7.42□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 YNL017CYNL017C 339 nt7.42□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 DFR1YOR236W 636 nt7.42□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.41□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 SMC5YOL034W 3282 nt7.4□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 DON1YDR273W 1098 nt7.4□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 MEH1YKR007W 555 nt7.4□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 ARC35YNR035C 1029 nt7.4□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 VMA2YBR127C 1554 nt7.4□□□□□ -1.22
UBX2Q04228 CYB2YML054C 1776 nt7.4□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 NTE1YML059C 5040 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 ECM14YHR132C 1293 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 MTC2YKL098W 1074 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 GCN3YKR026C 918 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 RPS3YNL178W 723 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 Q0010Q0010 387 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 RGD2YFL047W 2145 nt7.39□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 GPH1YPR160W 2709 nt7.38□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 HEM1YDR232W 1647 nt7.38□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 ERS1YCR075C 783 nt7.38□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 YET3YDL072C 612 nt7.38□□□□□ -1.23
UBX2Q04228 NTG1YAL015C 1200 nt7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms