Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARID5AQ03989 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID5AQ03989 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARID5AQ03989 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID5AQ03989 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms