Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX5Q02548 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX5Q02548 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PAX5Q02548 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX5Q02548 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms