Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFRSF17Q02223 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF17Q02223 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF17Q02223 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF17Q02223 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms