Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX1P83916 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX1P83916 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX1P83916 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX1P83916 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX1P83916 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX1P83916 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX1P83916 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX1P83916 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX1P83916 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX1P83916 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX1P83916 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX1P83916 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX1P83916 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX1P83916 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX1P83916 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX1P83916 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX1P83916 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX1P83916 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX1P83916 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX1P83916 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX1P83916 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX1P83916 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX1P83916 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX1P83916 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CBX1P83916 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX1P83916 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX1P83916 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX1P83916 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX1P83916 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX1P83916 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX1P83916 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX1P83916 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX1P83916 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX1P83916 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX1P83916 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX1P83916 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX1P83916 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX1P83916 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX1P83916 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX1P83916 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX1P83916 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX1P83916 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX1P83916 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX1P83916 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX1P83916 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX1P83916 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX1P83916 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX1P83916 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX1P83916 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX1P83916 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CBX1P83916 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX1P83916 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX1P83916 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX1P83916 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX1P83916 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX1P83916 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBX1P83916 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBX1P83916 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBX1P83916 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX1P83916 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX1P83916 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX1P83916 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX1P83916 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX1P83916 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX1P83916 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX1P83916 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX1P83916 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX1P83916 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX1P83916 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX1P83916 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX1P83916 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX1P83916 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX1P83916 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX1P83916 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX1P83916 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX1P83916 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX1P83916 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX1P83916 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX1P83916 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX1P83916 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX1P83916 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX1P83916 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX1P83916 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX1P83916 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX1P83916 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX1P83916 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX1P83916 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX1P83916 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX1P83916 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX1P83916 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX1P83916 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX1P83916 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX1P83916 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX1P83916 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX1P83916 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBX1P83916 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CBX1P83916 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBX1P83916 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX1P83916 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms