Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL20P78556 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL20P78556 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCL20P78556 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL20P78556 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL20P78556 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL20P78556 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL20P78556 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCL20P78556 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL20P78556 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL20P78556 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL20P78556 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL20P78556 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL20P78556 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL20P78556 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL20P78556 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL20P78556 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL20P78556 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL20P78556 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL20P78556 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL20P78556 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL20P78556 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL20P78556 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL20P78556 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL20P78556 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL20P78556 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL20P78556 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL20P78556 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL20P78556 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL20P78556 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL20P78556 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL20P78556 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL20P78556 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL20P78556 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL20P78556 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL20P78556 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL20P78556 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL20P78556 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL20P78556 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL20P78556 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL20P78556 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL20P78556 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL20P78556 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL20P78556 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL20P78556 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL20P78556 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL20P78556 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL20P78556 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL20P78556 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL20P78556 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL20P78556 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL20P78556 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL20P78556 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL20P78556 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL20P78556 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL20P78556 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL20P78556 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL20P78556 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL20P78556 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL20P78556 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL20P78556 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL20P78556 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL20P78556 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL20P78556 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL20P78556 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL20P78556 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL20P78556 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL20P78556 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL20P78556 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL20P78556 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL20P78556 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL20P78556 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL20P78556 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL20P78556 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL20P78556 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL20P78556 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL20P78556 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL20P78556 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL20P78556 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL20P78556 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL20P78556 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL20P78556 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL20P78556 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL20P78556 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL20P78556 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL20P78556 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL20P78556 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL20P78556 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms