Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT83P78385 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT83P78385 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT83P78385 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT83P78385 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT83P78385 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT83P78385 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT83P78385 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT83P78385 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT83P78385 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT83P78385 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT83P78385 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT83P78385 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT83P78385 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT83P78385 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT83P78385 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT83P78385 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT83P78385 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT83P78385 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT83P78385 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT83P78385 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT83P78385 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT83P78385 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT83P78385 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT83P78385 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT83P78385 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT83P78385 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT83P78385 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT83P78385 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT83P78385 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT83P78385 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT83P78385 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT83P78385 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT83P78385 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT83P78385 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT83P78385 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT83P78385 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT83P78385 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT83P78385 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT83P78385 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT83P78385 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT83P78385 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT83P78385 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT83P78385 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT83P78385 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT83P78385 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT83P78385 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT83P78385 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT83P78385 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT83P78385 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT83P78385 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT83P78385 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT83P78385 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT83P78385 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT83P78385 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT83P78385 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT83P78385 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT83P78385 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT83P78385 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT83P78385 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT83P78385 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT83P78385 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT83P78385 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT83P78385 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT83P78385 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT83P78385 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT83P78385 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT83P78385 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT83P78385 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT83P78385 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT83P78385 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT83P78385 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT83P78385 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT83P78385 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT83P78385 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT83P78385 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT83P78385 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT83P78385 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT83P78385 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT83P78385 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT83P78385 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT83P78385 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT83P78385 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT83P78385 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT83P78385 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT83P78385 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT83P78385 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT83P78385 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT83P78385 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT83P78385 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT83P78385 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT83P78385 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT83P78385 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT83P78385 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT83P78385 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT83P78385 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT83P78385 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT83P78385 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT83P78385 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT83P78385 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms