Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC5P78333 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC5P78333 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC5P78333 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC5P78333 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC5P78333 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC5P78333 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC5P78333 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC5P78333 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC5P78333 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC5P78333 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC5P78333 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC5P78333 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC5P78333 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC5P78333 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC5P78333 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC5P78333 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC5P78333 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC5P78333 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC5P78333 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC5P78333 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC5P78333 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC5P78333 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC5P78333 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC5P78333 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC5P78333 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC5P78333 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC5P78333 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC5P78333 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC5P78333 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC5P78333 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC5P78333 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC5P78333 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC5P78333 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC5P78333 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC5P78333 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC5P78333 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC5P78333 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC5P78333 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC5P78333 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC5P78333 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC5P78333 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC5P78333 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC5P78333 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GPC5P78333 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC5P78333 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC5P78333 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC5P78333 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC5P78333 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC5P78333 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC5P78333 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC5P78333 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC5P78333 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC5P78333 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC5P78333 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC5P78333 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC5P78333 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC5P78333 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC5P78333 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC5P78333 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC5P78333 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC5P78333 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC5P78333 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC5P78333 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC5P78333 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC5P78333 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC5P78333 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC5P78333 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC5P78333 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC5P78333 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC5P78333 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC5P78333 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC5P78333 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC5P78333 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC5P78333 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC5P78333 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC5P78333 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC5P78333 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC5P78333 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC5P78333 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC5P78333 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPC5P78333 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPC5P78333 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC5P78333 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC5P78333 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC5P78333 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC5P78333 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC5P78333 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC5P78333 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC5P78333 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC5P78333 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC5P78333 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC5P78333 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC5P78333 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC5P78333 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC5P78333 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC5P78333 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC5P78333 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC5P78333 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC5P78333 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms