Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP46P62068 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP46P62068 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP46P62068 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP46P62068 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP46P62068 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP46P62068 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP46P62068 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP46P62068 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP46P62068 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP46P62068 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP46P62068 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP46P62068 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP46P62068 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP46P62068 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP46P62068 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP46P62068 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP46P62068 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP46P62068 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP46P62068 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP46P62068 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP46P62068 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP46P62068 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP46P62068 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP46P62068 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP46P62068 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP46P62068 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP46P62068 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP46P62068 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP46P62068 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP46P62068 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP46P62068 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP46P62068 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP46P62068 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP46P62068 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP46P62068 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP46P62068 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP46P62068 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP46P62068 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP46P62068 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP46P62068 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP46P62068 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP46P62068 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP46P62068 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP46P62068 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP46P62068 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP46P62068 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP46P62068 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP46P62068 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP46P62068 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP46P62068 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP46P62068 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP46P62068 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP46P62068 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP46P62068 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP46P62068 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP46P62068 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP46P62068 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP46P62068 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP46P62068 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP46P62068 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP46P62068 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP46P62068 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP46P62068 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP46P62068 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP46P62068 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP46P62068 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP46P62068 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP46P62068 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP46P62068 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP46P62068 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP46P62068 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP46P62068 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP46P62068 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP46P62068 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP46P62068 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP46P62068 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP46P62068 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP46P62068 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP46P62068 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP46P62068 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP46P62068 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP46P62068 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP46P62068 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP46P62068 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP46P62068 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP46P62068 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP46P62068 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP46P62068 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP46P62068 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP46P62068 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP46P62068 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP46P62068 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP46P62068 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP46P62068 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP46P62068 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP46P62068 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP46P62068 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP46P62068 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP46P62068 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms