Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL27P61353 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL27P61353 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL27P61353 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL27P61353 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL27P61353 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL27P61353 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL27P61353 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL27P61353 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL27P61353 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPL27P61353 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL27P61353 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL27P61353 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL27P61353 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL27P61353 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL27P61353 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL27P61353 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL27P61353 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL27P61353 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL27P61353 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL27P61353 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL27P61353 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL27P61353 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL27P61353 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL27P61353 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL27P61353 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL27P61353 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL27P61353 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL27P61353 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL27P61353 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL27P61353 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL27P61353 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL27P61353 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL27P61353 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL27P61353 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL27P61353 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL27P61353 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL27P61353 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL27P61353 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL27P61353 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL27P61353 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL27P61353 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL27P61353 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL27P61353 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL27P61353 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL27P61353 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL27P61353 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL27P61353 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL27P61353 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL27P61353 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL27P61353 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL27P61353 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL27P61353 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL27P61353 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL27P61353 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL27P61353 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL27P61353 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL27P61353 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL27P61353 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL27P61353 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL27P61353 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL27P61353 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL27P61353 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL27P61353 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL27P61353 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL27P61353 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL27P61353 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL27P61353 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL27P61353 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL27P61353 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL27P61353 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL27P61353 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL27P61353 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL27P61353 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL27P61353 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL27P61353 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL27P61353 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL27P61353 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL27P61353 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL27P61353 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL27P61353 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL27P61353 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL27P61353 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL27P61353 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL27P61353 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL27P61353 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL27P61353 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL27P61353 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL27P61353 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms