Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSDMDP57764 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GSDMDP57764 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GSDMDP57764 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GSDMDP57764 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GSDMDP57764 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms