Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RIPPLY3P57055 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RIPPLY3P57055 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY3P57055 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms