Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME5P56597 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME5P56597 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME5P56597 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME5P56597 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME5P56597 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME5P56597 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME5P56597 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME5P56597 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME5P56597 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME5P56597 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME5P56597 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NME5P56597 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME5P56597 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME5P56597 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME5P56597 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME5P56597 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME5P56597 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME5P56597 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME5P56597 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME5P56597 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME5P56597 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME5P56597 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME5P56597 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME5P56597 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME5P56597 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME5P56597 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME5P56597 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME5P56597 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME5P56597 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME5P56597 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME5P56597 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME5P56597 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME5P56597 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME5P56597 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME5P56597 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME5P56597 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME5P56597 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME5P56597 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME5P56597 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME5P56597 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME5P56597 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME5P56597 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME5P56597 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME5P56597 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME5P56597 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME5P56597 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME5P56597 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME5P56597 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME5P56597 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME5P56597 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME5P56597 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME5P56597 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME5P56597 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME5P56597 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME5P56597 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME5P56597 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME5P56597 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME5P56597 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME5P56597 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME5P56597 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME5P56597 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME5P56597 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME5P56597 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME5P56597 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME5P56597 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME5P56597 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NME5P56597 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME5P56597 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME5P56597 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME5P56597 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NME5P56597 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME5P56597 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME5P56597 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME5P56597 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME5P56597 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NME5P56597 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME5P56597 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME5P56597 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NME5P56597 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME5P56597 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME5P56597 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME5P56597 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME5P56597 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME5P56597 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME5P56597 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME5P56597 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME5P56597 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NME5P56597 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NME5P56597 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NME5P56597 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NME5P56597 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NME5P56597 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NME5P56597 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NME5P56597 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NME5P56597 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NME5P56597 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NME5P56597 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NME5P56597 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NME5P56597 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms