Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARL4CP56559 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARL4CP56559 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARL4CP56559 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARL4CP56559 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms