Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX9P55771 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX9P55771 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX9P55771 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX9P55771 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX9P55771 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX9P55771 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX9P55771 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX9P55771 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX9P55771 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX9P55771 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX9P55771 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX9P55771 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX9P55771 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX9P55771 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX9P55771 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX9P55771 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX9P55771 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX9P55771 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX9P55771 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX9P55771 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX9P55771 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX9P55771 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX9P55771 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX9P55771 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX9P55771 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX9P55771 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX9P55771 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAX9P55771 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAX9P55771 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAX9P55771 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAX9P55771 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX9P55771 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX9P55771 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX9P55771 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX9P55771 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX9P55771 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX9P55771 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX9P55771 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX9P55771 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX9P55771 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX9P55771 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX9P55771 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX9P55771 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX9P55771 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX9P55771 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX9P55771 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX9P55771 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX9P55771 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX9P55771 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX9P55771 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX9P55771 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX9P55771 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX9P55771 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX9P55771 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX9P55771 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX9P55771 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX9P55771 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX9P55771 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX9P55771 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX9P55771 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX9P55771 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX9P55771 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX9P55771 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX9P55771 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX9P55771 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX9P55771 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX9P55771 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX9P55771 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms