Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRISP1P54107 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRISP1P54107 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRISP1P54107 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms