Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IST1P53990 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IST1P53990 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IST1P53990 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IST1P53990 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IST1P53990 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IST1P53990 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IST1P53990 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IST1P53990 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IST1P53990 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IST1P53990 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IST1P53990 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IST1P53990 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IST1P53990 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IST1P53990 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IST1P53990 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IST1P53990 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IST1P53990 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IST1P53990 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IST1P53990 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IST1P53990 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IST1P53990 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IST1P53990 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IST1P53990 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IST1P53990 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IST1P53990 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IST1P53990 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IST1P53990 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IST1P53990 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IST1P53990 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IST1P53990 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IST1P53990 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IST1P53990 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IST1P53990 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IST1P53990 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IST1P53990 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IST1P53990 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IST1P53990 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IST1P53990 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IST1P53990 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IST1P53990 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IST1P53990 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IST1P53990 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IST1P53990 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IST1P53990 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IST1P53990 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IST1P53990 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IST1P53990 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IST1P53990 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IST1P53990 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IST1P53990 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IST1P53990 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IST1P53990 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IST1P53990 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IST1P53990 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IST1P53990 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IST1P53990 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IST1P53990 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IST1P53990 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IST1P53990 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IST1P53990 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IST1P53990 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IST1P53990 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IST1P53990 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IST1P53990 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IST1P53990 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IST1P53990 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IST1P53990 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IST1P53990 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IST1P53990 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IST1P53990 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IST1P53990 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IST1P53990 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IST1P53990 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IST1P53990 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IST1P53990 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IST1P53990 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IST1P53990 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IST1P53990 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IST1P53990 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IST1P53990 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IST1P53990 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IST1P53990 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IST1P53990 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IST1P53990 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IST1P53990 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IST1P53990 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IST1P53990 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms