Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF138P52744 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF138P52744 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF138P52744 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms