Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK2P51955 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK2P51955 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK2P51955 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK2P51955 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK2P51955 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEK2P51955 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEK2P51955 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEK2P51955 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEK2P51955 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEK2P51955 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEK2P51955 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK2P51955 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK2P51955 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK2P51955 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK2P51955 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK2P51955 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK2P51955 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK2P51955 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEK2P51955 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEK2P51955 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEK2P51955 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEK2P51955 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEK2P51955 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEK2P51955 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEK2P51955 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEK2P51955 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEK2P51955 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEK2P51955 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEK2P51955 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEK2P51955 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEK2P51955 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEK2P51955 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK2P51955 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK2P51955 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK2P51955 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK2P51955 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK2P51955 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK2P51955 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEK2P51955 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEK2P51955 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK2P51955 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK2P51955 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK2P51955 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK2P51955 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK2P51955 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK2P51955 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEK2P51955 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK2P51955 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK2P51955 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK2P51955 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEK2P51955 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK2P51955 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK2P51955 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK2P51955 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK2P51955 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK2P51955 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK2P51955 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK2P51955 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEK2P51955 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK2P51955 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK2P51955 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK2P51955 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK2P51955 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK2P51955 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK2P51955 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEK2P51955 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK2P51955 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK2P51955 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK2P51955 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEK2P51955 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEK2P51955 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK2P51955 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK2P51955 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK2P51955 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK2P51955 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK2P51955 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEK2P51955 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK2P51955 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK2P51955 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK2P51955 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK2P51955 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEK2P51955 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK2P51955 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK2P51955 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK2P51955 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEK2P51955 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEK2P51955 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms