Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLCSP50747 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLCSP50747 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLCSP50747 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLCSP50747 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLCSP50747 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLCSP50747 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLCSP50747 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLCSP50747 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLCSP50747 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLCSP50747 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLCSP50747 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLCSP50747 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLCSP50747 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLCSP50747 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLCSP50747 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLCSP50747 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLCSP50747 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HLCSP50747 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLCSP50747 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLCSP50747 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLCSP50747 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLCSP50747 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLCSP50747 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLCSP50747 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLCSP50747 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLCSP50747 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLCSP50747 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLCSP50747 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLCSP50747 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HLCSP50747 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLCSP50747 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLCSP50747 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HLCSP50747 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLCSP50747 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLCSP50747 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLCSP50747 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLCSP50747 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLCSP50747 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLCSP50747 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLCSP50747 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLCSP50747 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLCSP50747 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLCSP50747 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLCSP50747 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLCSP50747 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLCSP50747 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLCSP50747 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLCSP50747 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLCSP50747 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLCSP50747 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLCSP50747 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLCSP50747 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLCSP50747 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLCSP50747 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLCSP50747 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLCSP50747 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLCSP50747 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLCSP50747 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLCSP50747 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLCSP50747 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HLCSP50747 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLCSP50747 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLCSP50747 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLCSP50747 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLCSP50747 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLCSP50747 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLCSP50747 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLCSP50747 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLCSP50747 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLCSP50747 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLCSP50747 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLCSP50747 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLCSP50747 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLCSP50747 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLCSP50747 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLCSP50747 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLCSP50747 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLCSP50747 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLCSP50747 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLCSP50747 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLCSP50747 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLCSP50747 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLCSP50747 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLCSP50747 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLCSP50747 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HLCSP50747 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLCSP50747 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLCSP50747 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLCSP50747 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLCSP50747 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HLCSP50747 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLCSP50747 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLCSP50747 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLCSP50747 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLCSP50747 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLCSP50747 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLCSP50747 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLCSP50747 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLCSP50747 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms