Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSK3BP49841 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSK3BP49841 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSK3BP49841 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms