Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PSMB3P49720 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB3P49720 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB3P49720 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.6 ms