Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRIM2P49643 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRIM2P49643 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM2P49643 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms