Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD97P48960 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD97P48960 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD97P48960 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD97P48960 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD97P48960 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD97P48960 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD97P48960 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD97P48960 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD97P48960 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD97P48960 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD97P48960 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD97P48960 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD97P48960 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD97P48960 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD97P48960 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD97P48960 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD97P48960 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD97P48960 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD97P48960 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD97P48960 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD97P48960 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD97P48960 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD97P48960 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD97P48960 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD97P48960 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD97P48960 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD97P48960 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD97P48960 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD97P48960 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD97P48960 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD97P48960 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD97P48960 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD97P48960 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD97P48960 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD97P48960 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD97P48960 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD97P48960 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD97P48960 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD97P48960 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD97P48960 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD97P48960 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD97P48960 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD97P48960 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD97P48960 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD97P48960 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD97P48960 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD97P48960 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD97P48960 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD97P48960 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD97P48960 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD97P48960 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD97P48960 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD97P48960 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD97P48960 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD97P48960 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD97P48960 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD97P48960 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD97P48960 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD97P48960 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD97P48960 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD97P48960 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD97P48960 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD97P48960 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD97P48960 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD97P48960 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CD97P48960 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CD97P48960 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD97P48960 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD97P48960 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD97P48960 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD97P48960 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD97P48960 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD97P48960 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD97P48960 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CD97P48960 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD97P48960 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD97P48960 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD97P48960 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD97P48960 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD97P48960 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD97P48960 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD97P48960 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD97P48960 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD97P48960 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD97P48960 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD97P48960 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD97P48960 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD97P48960 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD97P48960 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms