Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSN1S1P47710 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSN1S1P47710 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSN1S1P47710 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms