Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRXP46100 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRXP46100 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRXP46100 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRXP46100 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRXP46100 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRXP46100 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRXP46100 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRXP46100 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRXP46100 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRXP46100 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRXP46100 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRXP46100 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRXP46100 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRXP46100 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRXP46100 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRXP46100 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRXP46100 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRXP46100 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRXP46100 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRXP46100 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRXP46100 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRXP46100 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRXP46100 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRXP46100 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRXP46100 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRXP46100 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRXP46100 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRXP46100 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRXP46100 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRXP46100 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRXP46100 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRXP46100 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRXP46100 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRXP46100 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRXP46100 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRXP46100 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRXP46100 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATRXP46100 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRXP46100 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRXP46100 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRXP46100 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRXP46100 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATRXP46100 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATRXP46100 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRXP46100 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRXP46100 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRXP46100 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRXP46100 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRXP46100 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRXP46100 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATRXP46100 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRXP46100 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATRXP46100 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRXP46100 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRXP46100 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRXP46100 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRXP46100 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATRXP46100 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRXP46100 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRXP46100 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRXP46100 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRXP46100 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRXP46100 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRXP46100 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRXP46100 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRXP46100 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRXP46100 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATRXP46100 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATRXP46100 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRXP46100 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRXP46100 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATRXP46100 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRXP46100 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATRXP46100 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRXP46100 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRXP46100 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATRXP46100 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRXP46100 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRXP46100 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRXP46100 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRXP46100 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATRXP46100 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRXP46100 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRXP46100 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATRXP46100 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRXP46100 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRXP46100 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATRXP46100 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRXP46100 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRXP46100 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRXP46100 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRXP46100 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATRXP46100 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRXP46100 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRXP46100 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRXP46100 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRXP46100 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRXP46100 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATRXP46100 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms