Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAGEA3P43357 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MAGEA3P43357 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms