Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 EMP65YER140W 1671 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 RGD2YFL047W 2145 nt6.55□□□□□ -1.36
UFE1P41834 VPS24YKL041W 675 nt6.54□□□□□ -1.36
UFE1P41834 MIA40YKL195W 1212 nt6.54□□□□□ -1.36
UFE1P41834 MEU1YLR017W 1014 nt6.54□□□□□ -1.36
UFE1P41834 ECM30YLR436C 3825 nt6.54□□□□□ -1.36
UFE1P41834 ARC35YNR035C 1029 nt6.54□□□□□ -1.36
UFE1P41834 SLA2YNL243W 2907 nt6.54□□□□□ -1.36
UFE1P41834 ERS1YCR075C 783 nt6.53□□□□□ -1.36
UFE1P41834 HVG1YER039C 750 nt6.53□□□□□ -1.36
UFE1P41834 PRE3YJL001W 648 nt6.53□□□□□ -1.36
UFE1P41834 TAH11YJR046W 1815 nt6.53□□□□□ -1.36
UFE1P41834 YGR054WYGR054W 1929 nt6.52□□□□□ -1.37
UFE1P41834 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.52□□□□□ -1.37
UFE1P41834 PTC4YBR125C 1182 nt6.52□□□□□ -1.37
UFE1P41834 YLL066CYLL066C 3618 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 YLL067CYLL067C 3618 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 EDE1YBL047C 4146 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 PAC10YGR078C 600 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 OGG1YML060W 1131 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 FPR3YML074C 1236 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 GTO3YMR251W 1101 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 KSH1YNL024C-A 219 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 RPS28AYOR167C 204 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 ERG1YGR175C 1491 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 MIP1YOR330C 3765 nt6.51□□□□□ -1.37
UFE1P41834 CCT3YJL014W 1605 nt6.5□□□□□ -1.37
UFE1P41834 YHL018WYHL018W 363 nt6.5□□□□□ -1.37
UFE1P41834 MDE1YJR024C 735 nt6.5□□□□□ -1.37
UFE1P41834 ADH5YBR145W 1056 nt6.5□□□□□ -1.37
UFE1P41834 GPA1YHR005C 1419 nt6.5□□□□□ -1.37
UFE1P41834 YJR084WYJR084W 1272 nt6.49□□□□□ -1.37
UFE1P41834 GCN3YKR026C 918 nt6.49□□□□□ -1.37
UFE1P41834 ZRT2YLR130C 1269 nt6.49□□□□□ -1.37
UFE1P41834 TSR3YOR006C 942 nt6.49□□□□□ -1.37
UFE1P41834 RFS1YBR052C 633 nt6.49□□□□□ -1.37
UFE1P41834 RVB2YPL235W 1416 nt6.49□□□□□ -1.37
UFE1P41834 YBR241CYBR241C 1467 nt6.48□□□□□ -1.37
UFE1P41834 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.48□□□□□ -1.37
UFE1P41834 TIM22YDL217C 624 nt6.48□□□□□ -1.37
UFE1P41834 AAT2YLR027C 1257 nt6.48□□□□□ -1.37
UFE1P41834 ECM31YBR176W 939 nt6.48□□□□□ -1.37
UFE1P41834 HEM1YDR232W 1647 nt6.47□□□□□ -1.37
UFE1P41834 YNR014WYNR014W 639 nt6.47□□□□□ -1.37
UFE1P41834 LDB16YCL005W 771 nt6.47□□□□□ -1.37
UFE1P41834 RAD59YDL059C 717 nt6.46□□□□□ -1.38
UFE1P41834 SDH4YDR178W 546 nt6.46□□□□□ -1.38
UFE1P41834 MOG1YJR074W 657 nt6.46□□□□□ -1.38
UFE1P41834 PSR2YLR019W 1194 nt6.46□□□□□ -1.38
UFE1P41834 GLC8YMR311C 690 nt6.46□□□□□ -1.38
UFE1P41834 YNL120CYNL120C 486 nt6.46□□□□□ -1.38
UFE1P41834 CYB2YML054C 1776 nt6.45□□□□□ -1.38
UFE1P41834 LYS21YDL131W 1323 nt6.45□□□□□ -1.38
UFE1P41834 PPT1YGR123C 1542 nt6.45□□□□□ -1.38
UFE1P41834 PRY3YJL078C 2646 nt6.45□□□□□ -1.38
UFE1P41834 CRF1YDR223W 1404 nt6.44□□□□□ -1.38
UFE1P41834 MEH1YKR007W 555 nt6.44□□□□□ -1.38
UFE1P41834 IVY1YDR229W 1362 nt6.44□□□□□ -1.38
UFE1P41834 YDR415CYDR415C 1125 nt6.43□□□□□ -1.38
UFE1P41834 HHY1YEL059W 309 nt6.43□□□□□ -1.38
UFE1P41834 RGT2YDL138W 2292 nt6.43□□□□□ -1.38
UFE1P41834 YPT1YFL038C 621 nt6.42□□□□□ -1.38
UFE1P41834 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.42□□□□□ -1.38
UFE1P41834 COX16YJL003W 357 nt6.42□□□□□ -1.38
UFE1P41834 ERP2YAL007C 648 nt6.42□□□□□ -1.38
UFE1P41834 YKR032WYKR032W 315 nt6.42□□□□□ -1.38
UFE1P41834 GPH1YPR160W 2709 nt6.42□□□□□ -1.38
UFE1P41834 PEX3YDR329C 1326 nt6.42□□□□□ -1.38
UFE1P41834 PEX31YGR004W 1389 nt6.42□□□□□ -1.38
UFE1P41834 TKL2YBR117C 2046 nt6.42□□□□□ -1.38
UFE1P41834 NOG2YNR053C 1461 nt6.41□□□□□ -1.38
UFE1P41834 DPH5YLR172C 903 nt6.41□□□□□ -1.38
UFE1P41834 GSH1YJL101C 2037 nt6.41□□□□□ -1.38
UFE1P41834 CLN1YMR199W 1641 nt6.4□□□□□ -1.38
UFE1P41834 YDL218WYDL218W 954 nt6.4□□□□□ -1.38
UFE1P41834 HEM2YGL040C 1029 nt6.4□□□□□ -1.38
UFE1P41834 NTG1YAL015C 1200 nt6.4□□□□□ -1.38
UFE1P41834 TOS6YNL300W 309 nt6.4□□□□□ -1.38
UFE1P41834 AIM3YBR108W 2844 nt6.4□□□□□ -1.39
UFE1P41834 VMA2YBR127C 1554 nt6.4□□□□□ -1.39
UFE1P41834 YDR015CYDR015C 240 nt6.39□□□□□ -1.39
UFE1P41834 UIP4YPL186C 915 nt6.39□□□□□ -1.39
UFE1P41834 SKY1YMR216C 2229 nt6.39□□□□□ -1.39
UFE1P41834 MSY1YPL097W 1479 nt6.39□□□□□ -1.39
UFE1P41834 YNL285WYNL285W 372 nt6.38□□□□□ -1.39
UFE1P41834 YHR131CYHR131C 2553 nt6.37□□□□□ -1.39
UFE1P41834 FBA1YKL060C 1080 nt6.37□□□□□ -1.39
UFE1P41834 RPS3YNL178W 723 nt6.37□□□□□ -1.39
UFE1P41834 YOR200WYOR200W 399 nt6.37□□□□□ -1.39
UFE1P41834 SRF1YDL133W 1314 nt6.36□□□□□ -1.39
UFE1P41834 MAK31YCR020C-A 267 nt6.36□□□□□ -1.39
UFE1P41834 BUG1YDL099W 1026 nt6.36□□□□□ -1.39
UFE1P41834 SQT1YIR012W 1296 nt6.36□□□□□ -1.39
UFE1P41834 AIM24YJR080C 1185 nt6.36□□□□□ -1.39
UFE1P41834 YJR107WYJR107W 987 nt6.36□□□□□ -1.39
UFE1P41834 AMD2YDR242W 1650 nt6.36□□□□□ -1.39
UFE1P41834 POX1YGL205W 2247 nt6.35□□□□□ -1.39
UFE1P41834 HGH1YGR187C 1185 nt6.35□□□□□ -1.39
UFE1P41834 TIF2YJL138C 1188 nt6.35□□□□□ -1.39
UFE1P41834 TIF1YKR059W 1188 nt6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.2 ms